Los sistemas de control y automatización de centrales hidroeléctricas estan sujetos también a ataques cibernéticos. Robo de datos, interferencias en la operación y hasta indisponibilidad de unidades generadoras son algunas de las posibles consecuencias. Políticas de seguridad, capacitación de recursos humanos, además de implementaciones en el harware y software son acciones que reducen la vulnerabilidad.